Det arkæologiske museum i Agios Nikolaos er beliggende i den nordlige del af søen Voulismeni gaden Paleologos, 74, et par minutters gang fra byens centrum. Museet blev grundlagt i 1970 og har en rig samling af arkæologiske fund af præfekturet Lasithi.

Museet redegørelsen er placeret i otte messehaller og dækker et stort periode i historien fra den neolitiske til den romerske æra. Museets samling omfatter keramik, stenskulpturer, statuer, husgeråd, en række begravelses artefakter, guld smykker, bronze og elfenben artefakter fra en sjælden børns begravelse og meget mere.

Det mest imponerende udstilling af museet er kraniet af en ung mand, der findes i den romerske kirkegård i Potamos nær byen. Kraniet kan dateres tilbage til det 1. århundrede e.Kr. og kronet med en gylden diadem i form af oliven blade. I munden af ​​kraniet var en sølvmønt fra Polirinia (West Kreta), hvis frigivelse er blevet dateret til regeringstid den romerske kejser Tiberius. Coin, ifølge gammel tradition, transportøren måtte betale Charon sjæle til underverdenen Hades over floden Styx.

Af særlig interesse er de artefakter opdaget under udgravninger af den minoiske kirkegård i Aghia Fotia. Dette er en forhistorisk kirkegård, som blev fundet 260 Minoan grave, er stedet for de største arkæologiske udgravninger på Kreta. Grundlagt her i 1600 forskellige fartøjer fremstillet uden brug af en drejeskive og hans stil svarer til den kykladiske kunst.

Præsenteret i museet og artefakter fra den minoiske afvikling af Myrtos, blandt hvilke den vigtigste betragtes som "gudinde for Myrtos" - et skib i form af en kvindelig figur. Museet udstiller også artefakter fra Minoan Palace of Malia, herunder en storslået sten fartøj dræn i form af Triton.

Det arkæologiske museum i Agios Nikolaos er en af ​​de vigtigste museer på Kreta.