Grundlaget for de rigeste samlinger af Museum of Fine Arts gik til en omfattende samling af malerier Esterhazy familie. Museet udstiller kunstværker fra oldtiden til i dag.

Museet er opdelt i otte afdelinger: Egyptisk kunst, antikken, barok skulptur, gamle Master tegninger og prints, mestre det XIX århundrede, mestrene af det tyvende århundrede og moderne skulptur. De største navne forbundet med de gamle mestre - Tiepolo, Tintoretto, Veronese, Tizian, Raphael, Van Dyck, Bruegel, Rembrandt, Rubens, Hals, Hogarth, Dürer, Cranach, Holbein, Goya, Velazquez, El Greco og andre malere, hvis værker er tilgængelige i museet. Blandt de franske kunstnere af det XIX århundrede, er bedst repræsenteret af Delacroix, Corot og Manet. Museet ofte arrangerer skiftende udstillinger.