Zoo og Museum of Nature i Split blev doneret til byen på grund af begyndelsen af ​​det XX århundrede, flere værdifulde naturlige samlinger. Professor Umberto Dzhirometta i 1923 rejste spørgsmålet om oprettelsen af ​​Museum of Natural History. Byrådet Split tog sagen til anmeldelse og i 1924 grundlagde den første museum og Dzhirometta blev dens leder indtil sin død i 1939.

I de første år af sin eksistens, blev museet placeret i en af ​​de kommunale bygninger i byens centrum. Snart rummet var ikke nok, og museet blev flyttet til en af ​​bygningerne af parken Marjan. Sammen med museet åbnede en lille zoologisk have, der repræsenterer nogle arter af indfødte og eksotiske dyr. For første i det tidligere Jugoslavien akvariet ved siden af ​​bygningen af ​​museet blev bygget ekstra plads. Adskillige år senere Oceanarium blev lukket og omdannet til et lille bur. I dag i Split Zoo har over 300 arter af dyr.

Bygningen i parken Marjan på fjendtlighederne i 1991 blev lukket af sikkerhedsmæssige årsager. Derefter museet flyttede ind i fæstningen Gripe, og efter 1997 vendte han tilbage til Marian. Efter 2000 har på anmodning af medarbejdere til behovene i museet fået tildelt et nyt rum, med et samlet areal på omkring 1156 kvadratmeter, hvor museet begyndte at arbejde i januar 2002.

Før åbningen af ​​den nye direktør for museet blev reorganiseret museumssamlinger og berettede flere nye eksponeringer (f.eks samling af udstoppede dyr og fugle, afdelingen for geologi og palæontologi, entomologi, Institut for hvirveldyr og hvirvelløse dyr, etc.). Der blev også udført arbejde om behandling og systematisering af udstillingerne, feltarbejde i den centrale del af Dalmatien, adskillige udstillinger på museet og udenfor det. Hertil kommer, at museet personale involveret i talrige videnskabelige konferencer.

I stueetagen af ​​museet vært for en række udstillinger, og på de andre etager huse den permanente udstilling. Alle kan købe museet yderligere materiale om historie museet og lokale naturhistorie.