Ved udgangen af ​​det 19. århundrede, at stigningen i antallet af ortodokse befolkning nødvendiggjorde opførelsen af ​​en ny ortodoks katedral. Gældende på tidspunktet for den Transfiguration kirken blev lille til det voksende antal sognebørn, og også dens placering var ikke meget komfortable. Prins Sergey Shakhovskoy, som i 1885 blev udnævnt til guvernør i Estland, har indledt opførelsen af ​​en ortodoks kirke og fik tilladelse til at rejse midler til realisering af denne idé. Donationer modtages til opførelse her fra hele Rusland. Som et resultat, 15 September, 1899 blev indsamlet tilstrækkelige midler til opførelsen af ​​templet.

Katedralen besluttede at dedikere den hellige prins Alexander Nevsky, efter den ekstraordinære redning af Zar Alexander III og hans familie under en frygtelig togulykke, som fandt sted den 17 oktober, 1888. Meget omhyggeligt valgte stedet for opførelsen af ​​fremtidens kirke. Af de otte foreslåede muligheder standsede foran guvernørens palads i Vyshgorod. I august 1893 en højtidelig ceremoni på indvielse af stedet for fremtiden for domkirken. Ved ceremonien blev det bragt til mirakuløse ikonet for den Dormition af Guds Moder, leveret fra Pühtitsa kloster.

Projektet produceret akademiker af arkitekturen i katedralen i Mikhail Kalashnikov Transfiguration, en ekspert i kirkebygninger, et medlem af St. Petersburg Academy of Arts .  I første omgang, at projektet involverede installation af en marmor iconostasis, men i løbet af byggeriet blev det besluttet at udskifte på et træ forgyldt .  Ikoner blev skrevet i studiet maleri akademiker Alexander Nikanorovich Novoskoltseva .  Ifølge hans skitser Petersburg Master Emil Karlovich Shteinke gjort mosaikvinduer, der blev installeret i vinduerne i de vigtigste alter kapel .  Bell produceret i St. Petersborg i klokketårn plante købmand Vasily Mikhailovich Orlov .  Ringmærkning af klokkerne af katedralen er 11 .  Klokken kastede forskellige billeder og inskriptioner .  Resultatet var opførelsen af ​​templet trehprestoly foretaget på den model af Moskva kirker i det 17. århundrede, kan rumme omkring 1.500 mennesker .  Facade af katedralen dekoreret med mosaikker, lavet af akademiker arkitektur A . H . Frolov . 

Ceremony af indvielsen af ​​domkirken i navnet på Alexander Nevsky blev afholdt April 30, 1900, som blev gennemført Agafangel Hans nåde, biskoppen af ​​Riga og Mitava. Ceremonien deltog også St. rettigheder. om. Johannes af Kronstadt.

I begyndelsen af ​​20'erne, blev det besluttet at nedrive templet som "et monument over den russiske vold." Estland har endda begyndt at indsamle midler til gennemførelsen af ​​denne beslutning. I slutningen af ​​1928 et lovforslag blev indført for at nedrive St. Alexander Nevsky-katedralen. Temple formået at forsvare de kræfter i det globale ortodokse samfund. Under Anden Verdenskrig, katedralen blev lukket, og blev rejst igen spørgsmålet om dens nedrivning.

I de 60 år denne katedral vil blive konverteret under planetarium. Fra genopbygning, templet Alexander Nevsky formåede at redde den unge biskop af Tallinn og Estland Alexy, den kommende patriark af Moskva og Hele Rusland Alexy II. I 1999 blev som et tegn på særlig beskyttelse Tallinn Alexander Nevsky-katedralen have status Stavropegic, hvilket betyder direkte underordning af kirken, patriark af Moskva og Hele Rusland. Disse dage af action og katedralen er åben dagligt fra 8 til 9 timer.